TL;DR: PLR (Participação nos Lucros e Resultados) é regulada pela Lei 10.101/2000: isenta de INSS/FGTS, IR exclusivo na fonte (tabela própria). Bônus discricionário tem natureza salarial: incide INSS, FGTS, IRRF normalmente.
PLR exige acordo formal e regras claras de metas. Compensa pela isenção de encargos. Bônus avulso é mais simples mas mais caro.